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计算化学工程师

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上海亲合力生物医药科技股份有限公司
上海-浦东新区, 中国¥28,000 - ¥30,000 /月1个月前

职位描述

职位描述:具备前沿计算化学与结构生物学背景的AI计算专家,加入我们专注于抗体药物及ADC(抗体偶联药物)研发团队。您将作为连接“干实验(AI计算)”与“湿实验(分子生物学/生化)”的核心枢纽,运用深度学习(尤其是图神经网络)、分子对接及分子动力学模拟技术,深入解析抗原-抗体复合物的分子机制。主要职责包括:针对靶点蛋白与小分子Payload、Linker、多环肽及抗体CDR区进行相互作用模拟与亲和力预测;基于AI模型与物理能量函数(如Rosetta/FoldX)进行抗体亲和力成熟(Affinity Maturation)的突变体设计与优化;分析变构效应(Allostery)对结合模式的影响;与实验团队紧密配合,利用计算预测指导湿实验的筛选与验证,大幅提高抗体药物发现的成功率与研发效率。 任职要求:精通分子对接与分子动力学模拟软件(如Schrödinger、GROMACS、AutoDock等),熟悉图神经网络(GNN)相关框架(如PyG、DGL)及其在蛋白-多肽相互作用(PPI)预测与抗体-抗原结合界面分析中的实际应用,熟练使用FoldX、Rosetta或MM-GBSA/PBSA等工具进行复合物建模与结合自由能计算;需具备AI驱动的抗体亲和力成熟项目经验,熟悉生成式模型或主动学习框架(如EVOLVEpro、GearBind等)进行突变体筛选与排序,或具备小分子/多肽(含环肽)与靶点蛋白的对接计算及变构位点分析经验,靶点与小分子,靶点与linker,靶点与环肽的相互作用。以及变构后的相互作用计算。能够独立评估Linker与Payload对接模式对结合的影响;能清晰向实验团队阐释计算预测的分子机制。

Keywords
1-3年GROMACSFoldX

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