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个性化mRNA疫苗算法负责人

Technology
江苏先声医学诊断有限公司
南京-玄武区, 中国¥30,000 - ¥50,000 /月2周前

职位描述

岗位职责 1、抗原预测平台搭建,主导搭建针对肿瘤患者个体化治疗的 AI 驱动高通量抗原/新抗原预测平台,整合 WES、RNA-seq、免疫多肽质谱、HLA 分型等多组学数据; 2、核心免疫模型构建,构建与迭代抗原预测算法链路,包括 MHC-I/II 亲和力与稳定性预测、抗原加工剪切呈递、TCR-pMHC 识别、免疫原性评分与表位优先级排序; 3、多表位串联设计优化,主导个性化多表位串联算法开发,综合考量免疫原性、Linker 切割效率及新生连接表位规避; 4、负责 mRNA 编码区及非翻译区(5'UTR、CDS、3'UTR、PolyA尾)设计算法,结合 RNA 折叠、最小自由能(MFE)、密码子偏好性及二级结构可及性工具,优化分子稳定性和体内翻译效率; 5、与体内外生物学评价团队深度协同,建立高通量实验数据(质谱免疫肽组学、ELISPOT、单细胞测序等)向算法模型的自动反馈机制,实现算法的主动学习与快速迭代; 6、在公司现有AI能力基础上,逐步建立和迭代自研肿瘤新抗原预测与mRNA序列优化模型; 7、法规合规与前沿布局,推进算法的工程化规范部署(容器化、自动化、版本锁定),配合 IND 申报所需的数据追溯要求;跟踪肿瘤免疫与生成式 AI 前沿,推动平台专利布局。 任职要求 1、硕士及以上学历,生物信息学、计算生物学、免疫信息学、计算机科学、人工智能、应用数学、生物医学工程等相关专业或相关专业背景; 2、5年以上AI 算法研发经验,至少 3 年药物研发相关项目经验,2年以上 mRNA 疫苗(肿瘤治疗性疫苗、个体化新抗原疫苗)的算法开发/验证核心开发或管理经验; 3、有肿瘤 mRNA 疫苗或肿瘤新抗原疫苗开发经验,熟悉从抗原发现、序列设计到实验验证的核心流程,有主导或核心参与过至少 1 个管线推进至 IND 申报项目经验者优先; 4、熟练掌握主流免疫信息学及生信分析工具(如 NetMHCpan、MHCflurry、pVACseq、OptiType 等); 5、具备扎实的工程落地能力,精通 Python/R,熟悉主流深度学习框架(PyTorch/TensorFlow),熟悉生信流程引擎(Nextflow、Snakemake 等)及容器化部署; 6、具备与注册、医学、临床前等跨学科团队高效协作和做技术决策的综合能力。

Keywords
TensorFlowPyTorchPython

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