Quentin Secher
Diplômé d'un Master Bioinformatique
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MontpellierMembre depuis 31 juillet 2026
PythonSQLCypherBioCypherDocker
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À propos
Diplômé d'un Master en bio-informatique avec une solide expérience en analyse de données et en programmation (R/Python), je souhaite mettre mes compétences au service des projets de biosurveillance et d'évaluation d'impact environnemental au sein du PERL.
Expérience
Stage de M2 - IRD
(2026-02 - 2026-07)
- Amélioration et enrichissement d'un graphe de connaissances multi-espèces.
- Évaluation et benchmark de modèles de graph embeddings pour inférer des relations inédites chez le sorgho via les connaissances d'autres plantes mieux connues.
Stage de M1 - IRD
(2025-05 - 2025-08)
- Développement d'un pipeline ETL pour intégrer des données multi-omiques et multi-espèces hétérogènes au sein d'un graphe de connaissances.
- Modélisation du schéma de données avec BioCypher pour assurer l'interopérabilité des entités biologiques.
- Export et déploiement du graphe sur Neo4j (Docker), puis exploration via des requêtes Cypher pour déduire de nouvelles relations gène-phénotype.
- Rédaction d'une documentation pour faciliter l'interrogation du graphe.
Assistant Administratif - TOTALENERGIES
(2024-06)
- Développement de scripts Python pour la conversion automatisée de flux de fichiers en PDF et leur intégration en base de données.
- Création d'un script Python d'extraction de fichiers selon leur type afin de les trier par répertoire et d'isoler automatiquement les doublons.
Formation
Master - Bioinformatique - Université de Montpellier (2024 - 2026)
Licence - Informatique - Université de Pau et des pays de l'Adour (2022 - 2024)
BTS - Système Numérique option Informatique et Réseau - Lycée Saint-Cricq, Pau (2020 - 2022)
Compétences
Diplômé d'un Master Bioinformatique
